با قدرت گرفتن مادارا و آشکار شدن نقش چاکرای شش‌طریقت، اوبیتو میان گذشته، آرمان صلح و تصمیم‌هایش گرفتار می‌شود. کاکاشی، گارا و دیگران برای رساندن نیروی لازم به ناروتو در برابر تهدیدی بسیار فراتر از قبل تلاش می‌کنند.