در ادامه نبرد بزرگ نینجاها، گارا و ناروتو در برابر فشار سنگین مادارا و تهدیدهای جینچوریکی‌ها قرار می‌گیرند. تنش میان اراده نسل جدید و رؤیای خطرناک مادارا، مسیر جنگ را وارد مرحله‌ای حساس‌تر می‌کند.