کنشین در مسیر کیوتو با سایه‌ی سنگین شیشیو و یاران خطرناکش روبه‌رو می‌شود؛ دشمن‌هایی که فقط قدرت نمی‌خواهند، می‌خواهند گذشته‌ی باتوسای را دوباره بیدار کنند. حالا تصمیم قدیمی او برای نکشتن، سخت‌تر از همیشه امتحان می‌شود.