کونان در مسیر کیوتو سوار قطار سریع‌السیر می‌شود، اما شنیدن حرف‌های چند مرد مشکوک همه‌چیز را عوض می‌کند. حالا او باید بین صدها مسافر، صاحب یک کیف خطرناک را پیدا کند؛ آن هم وقتی هیچ‌کس حرف یک بچه را جدی نمی‌گیرد.