در مستعمره فضایی آرک، اگمن برای فعال کردن سلاحش دنبال کائوس امرالدهاست و سونیک و دوستانش باید جلویش را بگیرند. همزمان رازهای قدیمی پروژه شدو و حادثه پنجاه سال پیش کمکم سر از خاکستر درمیآورد.
